[美国]华盛顿，7月3日:去年，病理学家Jeffrey SoRelle博士和他的同事开发了一种COVID-19快速检测方法CoVarScan，可以检测SARS-CoV-2病毒中的8个热点特征。现在，CoVarScan已经在德克萨斯大学西南分校收集的4000多名患者样本上进行了测试，临床化学研究团队报告说，这种测试与其他诊断COVID-19的方法一样准确，并成功地在当前所有变种的COVID-19之间进行了区分。

病理学助理教授、该研究的资深作者SoRelle博士说:“通过这项测试，我们可以非常迅速地确定社区中存在哪些变异，以及是否有新的变异正在出现。”“当我们处理对治疗有不同反应的变异时，这对个别患者也有意义。”

德克萨斯大学西南分校昔日人类基因组学中心的检测结果帮助公共卫生领导人跟踪了COVID-19在得克萨斯州北部的传播，并根据变异的流行情况做出了政策决定。医生们还利用这些结果选择了对感染COVID-19重症患者的某些菌株更有效的单克隆抗体。

虽然存在一些其他的COVID-19检测方法，但它们通常要么检测SARS-CoV-2遗传物质的片段，要么检测病毒表面发现的小分子，不提供识别变异的信息。此外，许多研究人员担心这些测试在检测某些变异方面不准确——或者可能会错过未来的菌株。为了确定患者患的是哪种新冠病毒变体，科学家通常必须使用全基因组测序，这是一项耗时且昂贵的工作，需要依靠精密的设备和分析来确定病毒中包含的整个RNA序列。

2021年初，索雷尔博士和西南德克萨斯大学的同事们想跟踪目前的测试在检测新出现的SARS-CoV-2变种方面做得如何。但他们意识到对大量标本进行测序既不及时也不划算，所以他们自己设计了测试，在麦克德莫特中心下一代测序核心工作，该中心是尤金麦克德莫特人类生长与发展中心的一部分，由内科医学和分子遗传学教授海伦·霍布斯(Helen Hobbs)指导。

CoVarScan聚焦于SARS-CoV-2的八个区域，这些区域通常在病毒变体之间存在差异。它能检测到小的突变——构建RNA的序列是不同的——并测量随着病毒进化而趋于增长和收缩的重复性遗传区域的长度。该方法依赖于聚合酶链反应(PCR)——一种在大多数病理学实验室中常见的技术——在这八个感兴趣的位点复制和测量RNA。

为了测试CoVarScan的工作效果，SoRelle博士的团队对2021年4月至2022年2月在德克萨斯大学西南分校收集的4000多份covid -19阳性的鼻拭子样本进行了测试，样本来自有症状和无症状的患者。这些检测通过金标准全基因组测序进行了验证，医生利用这些结果为一些重症COVID-19患者选择治疗方案。

与全基因组测序相比，CoVarScan的敏感性为96%，特异性为99%。它识别并区分了新冠病毒的Delta、Mu、Lambda和欧米克隆(Omicron)变种，包括BA.2版本的欧米克隆(Omicron)，该版本曾被称为“隐形欧米克隆”，因为它在一些只检测欧米克隆菌株的测试中无法显示。

“这类测试的一个常见批评是，它需要不断调整新的变体，但CoVarScan在一年多的时间里不需要任何调整;它仍然表现得很好，”SoRelle博士说。“未来，如果我们确实需要调整它，我们可以很容易地在测试中添加多达20或30个额外的热点。”

SoRelle博士计划继续开发CoVarScan作为商业测试，并基于这项工作正在申请专利。作为变异基因分型PCR测试的发明者，SoRelle博士有权从其使用中获得收入。

推荐阅读：泰国房产